Regler om fakturanumre (mere end 1 system der laver nye fakturaer)

Hej,

Vi laver et it-system hvor en del af dette er et fakturerings-modul (de fakturaer dette laver har deres egen nummerserie).

Systemet kan overføre fakturaer til e-conomic regnskabssystemet, men dette gør man uden fakturanumre så de bliver født som ordrekladder i e-conomic (sådan er det nødt til at være i e-conomic medmindre man binder det hele op på at kunne spørge om nyt fakturanummer der hele tiden og det ønsker vi ikke).
Hvis alle fakturaer fødes i vores fakturerings modul kan man blot sørge for at numrene bliver de samme i e-conomic (baseret på den nummerserie der kører der) når man fakturerer regningerne der. Så de er 1:1 i sync.
Men nogle brugere af systemet vil gerne oprette ekstra fakturaer i e-conomic som vedrører en anden gren af deres forretning (hvor der er brug for fx valuta omregning, som vores fakturaringsmodul ikke har) og så kan man ikke længere holde de 2 steder i sync. når der fødes ekstra fakturaer i e-conomic.
De oprindelige fakturanumre fra faktureringsmodulet overføres iøvrigt til e-conomic, men som et reference nummer man kan sætte på en ordrekladde.

Er der noget til hindring for at gøre det på denne måde (hvor fakturanummer i vores system og det fakturanummer der får i e-conomic er forskelligt - dog linket sammen via dette referencenummer)?
Kundens kunde får jo udskrifter af faktura fra vores faktureringsmodul, som ikke svarer til det nummer der er i e-conomic i sidste ende til regnskabet. Er det ok?