Problemer med visning af filer og mapper

Har et problem med at windows ikke vil vise filer og mapper, efter jeg har fjernet en trojan fra maskinen.

Det er sikkert fordi den har rodet med rettighederne, da filer stadig er på maskinen, og kan ses i bla. Totalcommander, og filerne uden problemer han tilgåes fra programmer, som bla. Utorrent.

Ved drev visning, viser den dog tomme mapper og drev,  men stadig den korrekt forbrug på HDén.

Nogen med en ide om hvordan jeg får dette fikset ?

Edit:

Også  blev det lige fikset... den havde rettet i filernes attributter, så de fremstod som skjulte system filer.