Hvad bruger I til versionsstyret overførsel af website/platform?

Hej!

Jeg er i gang med et stort projekt, hvor vi efterhånden er nået så langt, fået brugere, som helst ikke skulle påvirkes af hvad vi sidder og udvikler på ved siden af. 

Vi har har i øjeblikket to ftp servere, hvor vi udvikler på den ene og overfører den "nye version" til den anden når det virker. Vi har forsøgt os med Transmit til at overfører alle de nye ting, men har haft et par uheld og får simpelthen ikke alle filerne med.

Mit håb var at der er nogen herinde som har en ide til en metode eller et program, som kan løse opgaven. 
Eventuel noget som I har brugt eller bruger til større projekter - vi sidder forresten ikke lokalt - så det skal helst kunne gøres fra ftp/server.

Tak for hjælpen!